When using "createAdditionalMasks()" the mask to not mathc the scans.

My suspicion is that:
as of for right now, the images have an index issue and therefore don't match the order of the original b-Scans.
Maybe implement a post-check, that overlays plots of original scan and (all interpolated?) masks?

Wenn beim Segmentieren eines Volumens an einem BScan unterbrochen wird, kann man nicht mehr direkt zu dieser Stelle zurückkehren. Wäre es möglich die Option zu implementieren, damit man wieder zu dem zuletzt segmentierten BScan zurückkehren und dort weiter segmentieren kann?

Wenn Endothel und OVD-Schicht nicht sichtbar (manchmal in Randbereichen der Kornea der Fall) und nicht segmentiert, wird da keine Maske ausgegeben. Ist es möglich, dennoch eine "leere" Maske zu generieren, damit später bei der Auswertung keine Lücke entsteht?

bei der manuellen Segmentierung passiert es öfters, dass es nicht zum nächsten Bscan weiterspringt, sondern mit folgender Fehlermeldung abbricht:
Unrecognized function or variable 'posEndo'.

  Error in segmentaScanDerivative (line 37)
    [~, posesOVD] = maxk(aScan(posEndo+offset:end), 3); %find OVD

  Error in mainSegmentationLoop (line 20)
    [mask, curve] = segmentaScanDerivative(b_Scan, label, frames);

  Error in Run (line 101)
  mainSegmentationLoop(DataStruct, ProcessedOctCube);

Die Reihenfolge der zusätzlich erstellten Masken (continuousMasks und thickMasks) stimmt nicht mit der Reihenfolge der ursprünglichen Masken überein. Es scheint als wäre die Zählweise nicht richtig, wie es beim Einlesen der Masken für die Erstellung der Thickness Map schon der Fall war. Es ist ein Sprung bei jeder 10ten Maske (wie periodisches Muster).