Kursdaten: Berlin, 6. Dezember 2022

In diesem GitHub Repository sind alle Materialien hinterlegt, die für das Tutorial Datenanalysen auf Basis des MII Kerndatensatzes (FHIR) benötigt werden. Damit wir im Kurs nicht von systemspezifischen Problemen aufgehalten werden, wird R und RStudio innerhalb eines Docker Containers betrieben werden, in dem alle Kursteilnehmer die gleichen Bedingungen vorfinden.

Daher ist vor dem Kurs eine kurze Vorbereitung notwendig, welche im folgenden beschrieben ist.

• Eigenes Notebook (mit Internetzugang)

• Programme:

  • Docker Desktop/Docker Compose
  • Git (Nützlich, aber nicht zwingend notwendig)

• Git Repository clonen: git clone https://github.com/palmjulia/R-Tutorial.git (Alternativ manuell herunterladen)
• Verzeichniswechsel ins lokale Repository cd R-Tutorial/docker
• Docker Image pullen mit docker-compose pull (Alternativ: Image selbst bauen, siehe README in R-Tutorial/docker)

Docker Container starten: docker-compose up -d.

Im Browser sollte jetzt nach einem Login unter der Adresse: 127.0.0.1:8787 eine R-Studio-Oberfläche verfügbar sein.

Username: rstudio, Passwort: pwd.

Wenn das der Fall ist, kann der Docker Container mit docker-compose down wieder heruntergefahren werden.

Bei Problemen in der Vorbereitung bitte Kontakt auf nehmen mit Julia Palm.