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Bonjour et bienvenue sur la page github de notre projet tutoriel ETE3. Il a pour but de présenter ce module Python, utile pour la manipulation et l'affichage d'arbres.

Vous y trouverez deux Jupyter Notebooks, intro.ipynb et demo.ipynb. Le premier a pour but d'introduire le module ainsi que les concepts importants pour la manipulation des arbres, phylogénétiques ou non. Le second fichier est, comme son nom l'indique, un notebook de démonstration, qui illustre quelques unes des fonctionnalités d'ETE3, comme l'enracinement ou la comparaison d'arbre, en passant par l'affichage avec le moteur programmable de dessin d'arbres.

Pour faciliter l'usage de ces notebooks, vous trouverez aussi les données nécessaires dans le dossier data, ainsi que l'environnement conda ayant permis de réaliser ces analyses, dans le fichier ete_env.yaml.