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Repositorio para consulta de avances de proyecto "Validacion del Método de Duplicación de J en proteínas". Autor Principal: Liat Colmenares V. Autores complementarios: Federico del Rio Portilla, Erick Feredico Del Rio Pulido & Ana Daniela del Rio Pulido. todos los derechos reservados

Python 45.99% Jupyter Notebook 54.01%
python3 artificial-neural-networks nmr-spectroscopy convolution

lcv_jdoubling_proyecto's Introduction

LCV_JDoubling_proyecto

Temas: Quimica, Resonancia Magnética Nuclear, Python, Señales, Constantes de acoplamiento, Inteligencia Artificial

Este proyecto desarrollado en Python, esta diseñado para resolver problemáticas basadas en la resolución de señales pobres de RMN, determinando la constante de acoplamiento de esta por medio del "Metodo modificado de duplicación de J" desarrollado por el Dr. Federico del Rio, investigador titular del Intstituto de Química de la UNAM

Objetivos: El principal objetivo es brindarle confiabilidad a los resultados de esta metodología conocida comúnmente como "J Doubling" a partir de algoritmos de inteligencia artificial como redes neuronales, etc.

Nota: librerías especiales a usar: nmrsim de Geoffrey Sametz (pip install nmrsim)

ANEXO I. CÓDIGOS DE DOCUMENTACIÓN Con el propósito de mantener un orden coherente entre los diferentes programas y documentos escritos durante el presente proyecto de investigación se declaran las siguientes condiciones: Trabajos Escritos. El nombre de todos los documentos constara de 4 partes, empezando por el propósito o tema del trabajo-TI1 ó TI2 (según sea el caso)-LCV (iniciales del nombre del/la autora)-semestre en curso. Ejemplos: PrimerAvance-TI1-LCV-2021_1 el cual hace referencia al primer avance formal en el proyecto desarrollado, trabajo de investigación 1 referente a la materia cursando, las iniciales de la autora y por último el semestre en curso. Si se quiere referir por ejemplo al plan de validación completo se tendría que escribir de la siguiente manera: PlanValidación-TI1-LCV-2021_1 y si existen veías versiones del mismo documento se precede el número de versión después del propósito del trabajo, PlanValidación001-TI1-LCV-2021_1. Programas. En este caso es mas sencillo ya que consta de dos partes principalmente, la primera es de igual manera el propósito del documento/programa seguido de la versión de esta separados por un guion bajo; en este caso se limitan a los siguientes temas:

  1. Simulat: Referido a las simulaciones teóricas realizadas con “nmrsim” o versiones anteriores
  2. JDoub: Referido al programa escrito en Python por Federico del Río Portilla
  3. SimxJDoub: Referido al programa conjunto de simulación de espectros junto con Duplicación de J
  4. Incert: Referido al programa realizado para el cálculo de la incertidumbre de Duplicación de J
  5. FinalVer: Referido a programa conjunto entre el Simulat+JDoub+Incert el cual arroja todos los resultados en una sola corrida Ejemplos: Para las primeras versiones de simulaciones de espectros se debe llamar Simulat_001 y para el programa conjunto de simulación y Duplicación de J seria SimxJDoub_001.

Repositorio para consulta de avances de proyecto "Validacion del Método de Duplicación de J en proteínas". Autor Principal: Liat Colmenares V. Autores complementarios: Federico del Rio Portilla, Erick Feredico Del Rio Pulido & Ana Daniela del Rio Pulido. Todos los derechos reservados

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