Cours "Principes d'imagerie biomédicale" à Polytechnique Montréal.

Ce répertoire contient le matériel de laboratoire pour ce cours.

Pour débuter avec Python, on recommande cet excellent tutoriel par Guillaume Sheehy.

Cliquez sur l'icône Binder:

Attendre que Binder termine de créer l'environnement (peut prendre 5-10 minutes), après cliquez sur le Jupyter notebook. Ex.: sous lab3-irm/GBM8378-lab3-IRM.ipynb.

Attention: Après 10 d'inactivité, Binder va s'arrêter et vous devrez le relancer à nouveau. Enregistrez votre travail avant de fermer le notebook ou il sera perdu.

git clone https://github.com/jcohenadad/GBM8378.git
cd GBM8378
git checkout r20230109

• Pour les usagers Windows, vous devrez peut-être installer git avant de cloner ce répertoire GitHub.
• Si git clone ne fonctionne pas, vous pouvez télécharger directement la dernière version de ce répertoire sur votre ordinateur.

Après, lancez les commandes suivantes pour créer l'environnement virtuel et ouvrir le notebook.

conda env create -f environment.yml # Seulement pour créer l'environnement (peut prendre quelques minutes)

# Lancer le jupyter notebook:
conda activate env-GBM8378  # À faire à chaque fois que vous voulez lancer le notebook
jupyter notebook  

• Assurez-vous que sur votre terminal, vous êtes bien dans le dossier GBM8378 lorsque vous appelez le fichier environment.yml
• Pour les usagers Windows, vous devrez peut-être écrire ces commandes dans Anaconda Prompt si cmdne reconnait pas conda.

Assurez-vous d'avoir la dernière version des fichiers en effectuant un git pull du répertoire avant chaque nouveau laboratoire. Déplacez vos Notebooks ailleurs si vous ne voulez pas qu'ils soient écrasés par la dernière version.

Sur le jupyter notebook, imprimez la page et exporter/enregistrer au format PDF.