flavjack / germinar Goto Github PK

I've been trying to figure out why I can not generate the graphs using the code provided. I tested the code in the example and it has the same issue, showing: "Error in fplot(data = plotdt, type = "bar", x = "temp", y = "grp", group = "nacl", : unused argument (ylimits = c(0, 120, 20))". Can you solve this issue? Thanks!

Consideration to public on CRAN.

• create test (for unit testing)
• Get rid local function from dplyr.
• Make a vignette for GerminaR

Flavito, remueve el tidyverse del description file (en Imports), ya que genera problemillas.

Vuelve a agregar los siguientes paquetes al import:

@Flavjack please cambia el nombre de tu funcion plot, pues esta ya existe en R-Base; para que no haya overlap entre funciones internas.

Sugerencias: plot_germ, plot_germinar, etc.

• Los datasets en los paquetes se guardan como .rda . Los formatos .Rdata o .rds no son aceptados.

• Evitar incluir archivos de R que no estén documentados.

• Evitar que las variables o argumentos de las funciones tengan nombres de funciones primivitas (dt, data y c). Esto genera problemas con la evaluación interna en el ambiente de la función. (ver https://adv-r.hadley.nz/environments.html)

• Dar referencias, usando DOIs, en el campo Description. Las nuevas politicias estan en https://cran.r-project.org/web/packages/submission_checklist.html.
  Ejemplo: https://github.com/snoweye/phyclust/blob/master/DESCRIPTION

Cuando compilo me sale este error en la documentación de una función llamada reexports(?), pero pareciera que no existe la función. Dale una revisada por si las dudas.

• En el archivo Description, específicamente en Imports, sólo se usa los paquetes que usas en los cálculos y el paquete shiny para runAPP. Los otros paquetes usados en el ShinyApp, no se incluyen. Solo pueden ir en Suggests [Resuelto]
• Para la función is.string se necesita el paquete assertthat, ya esta agregado. [Resuelto]

OJO: Resolver este issue después del terminar el #5
Aparentemente hay funciones de los paquetes (en rojo) que usas en la funciones, pero que no están referenciadas en el DESCRIPTION.