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blob3d's Introduction

Visualisation des protéines (3D) - modélisation d'interactions protéines/protéines.

M. Binet, G. Debras, J. Mainguy, A. Rohan et F. Soubès

Objectifs

Créer un web service dédié à cet étrange objet qui rassemble tous les domaines d'analyses bioinformatiques rencontrées dans les plateformes internationales.

Méthode

Vous devrez concevoir et implémenter un des services qui permette de réaliser des analyses bioinformatiques standard. La saisie ou l'importation de fichiers en entrée devront elles aussi proposées.

Une mission de coordination sera indispensable entre les groupes pour définir et assurer l'intégration de tous les services dans la même plateforme. Chaque groupe désignera 1 responsable pour cette tâche.

A l'issue du projet vous devrez réaliser un rapport de 20 à 30 pages sur votre travail, détaillant l'architecture qui a été conçue et les outils de gestion de projet que vous aurez utilisés éventuellement. Un intérêt particulier devra être porté sur l'utilisation de formats, qu'ils soient existants ou créés spécifiquement pour votre application.

Contraintes

Le plus souvent le code de nombreuses applications sont disponibles librement, votre travail consistera à intégrer (plugins, module, mise en librairie ...) ce code dans votre solution.

Si nécessaire, vous pourrez aussi connecter (réaliser des "pipeline") avec d'autres outils disponibles.

Votre solution devra contenir uniquement des outils - algorithmes ou logiciels - libre de droit.

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