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In this case, FIFA is an unknown word. No entry exists for FIFA in the dictionary.
When the word is unknown, extra fields 読み,発音 are not defined when using mecab-ipadic.

You can tell whether the word is unknown or not with -x option.

%mecab -x UNK
国際サッカー連盟（FIFA）の幹部が汚職により逮捕、29日にFIFA会長選が予定通り開催
国際 名詞,一般,,,,,国際,コクサイ,コクサイ
サッカー 名詞,一般,,,,,サッカー,サッカー,サッカー
連盟 名詞,一般,,,,,連盟,レンメイ,レンメイ
（ 記号,括弧開,,,,,（,（,（
FIFA UNK
） 記号,括弧閉,,,,,）,）,）
の 助詞,連体化,,,,,の,ノ,ノ
幹部 名詞,一般,,,,,幹部,カンブ,カンブ
が 助詞,格助詞,一般,,,,が,ガ,ガ
汚職 名詞,一般,,,,,汚職,オショク,オショク
により 助詞,格助詞,連語,,,,により,ニヨリ,ニヨリ
逮捕 名詞,サ変接続,,,,,逮捕,タイホ,タイホ
、 記号,読点,,,,,、,、,、
29 UNK
日 名詞,接尾,助数詞,,,,日,ニチ,ニチ
に 助詞,格助詞,一般,,,,に,ニ,ニ
FIFA UNK
会長 名詞,一般,,,,,会長,カイチョウ,カイチョー
選 名詞,接尾,一般,,,,選,セン,セン
が 助詞,格助詞,一般,,,,が,ガ,ガ
予定 名詞,サ変接続,,,,,予定,ヨテイ,ヨテイ
通り 名詞,接尾,一般,,,,通り,ドオリ,ドーリ
開催 名詞,サ変接続,,,,*,開催,カイサイ,カイサイ

from mecab.